Обсуждается роль и методология применения квантовых вычислений в задачах проектирования робастных интеллектуальных систем управления в условиях непредвиденных ситуаций управления. Разработан квантовый алгоритм управления самоорганизацией, содержащий как частный случай алгоритм управления самоорганизацией робастных баз знаний. Выполнение введенного термодинамического критерия (в виде минимума обобщенный энтропии в установленном соотношении между такими качественными характеристиками управления, как устойчивость, управляемость и робастность) является целью применения квантового алгоритма управления самоорганизацией баз знаний, используемого в контуре управления. На примере существенно нелинейного и глобально неустойчивого объекта управления рассмотрено применение квантового алгоритма управления самоорганизацией к решению задачи векторной оптимизации на основе принципа декомпозиции баз знаний.